Universitas Jayabaya didirikan pada tanggal 5 Oktober 1958, dengan Akta Notaris Liem Toeng Kie, Nomor : 17 tanggal 7 Oktober 1960 didirikan Yayasan sebagai badan penyelenggara Universitas yang berkedudukan di Jakarta, yang kemudian diubah dengan Akta Notaris Mohammad Said Tadjoedin, Nomor 221 tanggal 17 Agustus 1983. Tercatat sebagai pendiri adalah Moeslim Taher dan Ny. Yuyun Moeslim Taher.